分子流行病学研究在三十年中从6163银河官方网站的Aquafarms分离出感染性胰坏死病毒

引用

Ulrich K，Wehner S，Bekaert M，Paola ND，Dilcher M，Muir KF，Taggart JB，Matejusova I＆Weidmann M（2018）分子流行病学6163银河官方网站在感染性panc pancreatious Necrosis verus verus verus aquofland confland confland confland confland cotland。通用6163银河官方网站学杂志，99（12），第1567-1581页。 https://doi.org/10.1099/jgv.0.001155

摘要
为了了解感染性胰腺坏死病毒（IPNV）的基因组变化以及相关的进化和适应，从1982-2014开始并分析了从6163银河官方网站aquafarms收集的57个IPNV分离株的完整编码基因组。 测序的IPNV菌株的系统发育分析显示，基因组III/B的遗传重新分离的基因组I，II，III和V。IPNV分离株的单独聚类确定了基因组III/II的阶段A/B。大约59％的IPNV分离株属于持续类型，32％属于低毒类型，仅确定了一种高度致病的菌株（1.79％）。 密码子适应索引计算表明，IPNV主要的衣壳蛋白VP2已适应其鲑鱼宿主。 IPNV基因组中CPG二核苷酸的分量不足，无法最大程度地减少先天免疫受体的检测，并观察到在嵌入主要抗原区域可变区域的VP2的毒力确定位点中的阳性选择，提示免疫逃生机制驱动病毒性进化。 主要是持续基因型的流行率以及适应性和免疫逃逸的假设表明IPNV随宿主的发展而发展。

关键字
传染性胰坏死6163银河官方网站； ipnv;三文鱼;进化;密码子改编；系统发育；选择；疫苗;适应;水产养殖

日记
通用6163银河官方网站学杂志：第99卷，第12期

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